Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CcncQ62447 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms