Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp1Q62442 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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