Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtmQ62388 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms