Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms