Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpaQ62189 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms