Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssr4Q62186 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms