Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3bQ62141 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms