Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm1Q61937 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Npm1Q61937 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Npm1Q61937 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm1Q61937 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm1Q61937 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm1Q61937 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms