Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lrrn1Q61809 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lrrn1Q61809 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrn1Q61809 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Lrrn1Q61809 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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