Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga6Q61739 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga6Q61739 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms