Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms