Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi47Q61635 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms