Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EsrrbQ61539 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EsrrbQ61539 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms