Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msi1Q61474 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms