Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PcolceQ61398 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcolceQ61398 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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PcolceQ61398 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PcolceQ61398 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PcolceQ61398 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PcolceQ61398 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PcolceQ61398 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PcolceQ61398 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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