Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1eQ61290 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms