Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9a1Q61165 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9a1Q61165 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms