Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms