Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf3Q60803 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms