Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms