Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf3Q60765 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf3Q60765 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms