Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samhd1Q60710 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms