Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1d2Q60674 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms