Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sik1Q60670 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms