Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2f1Q60632 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr2f1Q60632 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms