Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CttnQ60598 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CttnQ60598 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms