Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms