Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms