Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Thoc6Q5U4D9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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