Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf1Q5U4C3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms