Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnajc11Q5U458 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms