Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r196Q5SVD5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r196Q5SVD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms