Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp2Q5SV77 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggnbp2Q5SV77 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms