Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TefmQ5SSK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms