Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

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Length 778 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brsk1Q5RJI5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Brsk1Q5RJI5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Brsk1Q5RJI5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms