Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarf1Q5ND28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf1Q5ND28 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms