Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc1Q5NCF2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms