Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Xaf1Q5NBU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms