Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnni3kQ5GIG6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3kQ5GIG6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms