Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt2Q5DTW2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt2Q5DTW2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms