Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CenpjQ569L8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpjQ569L8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms