Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms