Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Herc2Q4U2R1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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