Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxn3Q499D0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxn3Q499D0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms