Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930567H17RikQ3V0K5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms