Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SvipQ3UZP4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SvipQ3UZP4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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