Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5aQ3UXZ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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