Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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H2-Eb2Q3UUV9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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H2-Eb2Q3UUV9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2-Eb2Q3UUV9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H2-Eb2Q3UUV9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb2Q3UUV9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms