Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Obox3Q3UT54 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms