Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl4Q3URY0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms